フィンガープリンティングとは、化合物特有の遺伝子発現プロファイリングであり、Axceleadでは、化合物を用いたトランスクリプトームデータから、化合物に特異的なgene signatureを抽出し、フィンガープリンティングデータを作成します。
- Axceleadでは、AmpliSeqプラットフォームを有しており、少量のRNAから384プレートを用いたハイスループットのアッセイ系でトランスクリプトームデータを取得します。
- 化合物を用いたトランスクリプトームデータから、化合物に特異的なgene signatureを抽出します (フィンガープリンティング)。
- フィンガープリンティングデータを公共データベースと比較することにより、疾患候補の抽出(ドラッグリポジショニング)およびターゲット候補の抽出(ターゲットデコンボリューション)が可能になります。
ターゲットデコンボリューション:
フェノティピックスクリーニング
ヒット化合物のターゲット同定!
フェノティピックスクリーニングは細胞の表現型変化を指標とした化合物探索であり、従来のターゲットベースの化合物探索ではヒットしない化合物を見出す可能性がございます。同時に、ヒット化合物には作用メカニズムが不明な化合物が含まれる場合がございます。ヒット化合物を用いた創薬研究を進める上で、ヒット化合物の標的ターゲットの同定は解決するべき課題となります。我々は、ヒット化合物の標的ターゲットの同定を行うために、化合物から得たトランスクリプトームデータのフィンガープリンティングを行っており、標的分子の同定をいたします。
- フェノティピックスクリーニングから見出した化合物を用いたトランスクリプトームデータを取得し、化合物特有のgene signatureを抽出します (フィンガープリンティング)。
- 化合物特異的なgene signatureを用いて、ターゲット分子やMoAを推定します。
- 化合物の標的ターゲットを明らかにすることにより、創薬研究を加速することが可能でございます。
Axceleadの遺伝子改変動物作出機能や薬理薬効試験の統合的なサービスを提供することで、標的ターゲットの評価が可能となります。
Axcelead独自のデータベースを組み合わせることにより、標的ターゲットの確度高い推定を行います。
ドラッグリポジショニング:
新規適応疾患を探索!
ドラッグリポジショニングはお客様の財産である化合物を最大限に生かす事が可能であり、近年注目されているアプローチの一つでございます。開発化合物のライフサイクルマネージメントの観点から、既存化合物の適用疾患を拡大するために、適応疾患リスト作成が可能でございます。また、お客様が何らかの理由で研究開発を中止した化合物に関して、適応の可能性がある新たな適応疾患リストを作成いたします。
- 化合物を用いたトランスクリプトームデータから化合物に特異的なgene signatureを抽出します (フィンガープリンティングデータ)。
- 標的ターゲット分子に対する公共トランスクリプトームデータからターゲット分子に特異的なgene signatureを抽出します 。
- 化合物あるいは標的ターゲット分子に特異的なgene signatureを用いて、新規適用疾患候補を抽出します。
- これまでに培った経験により、解析の偽陽性・ノイズを効果的に除くことができます。
- In vitro研究の知識・経験を活かした総合的なサービスを提供しており、スピーディーに結果をご提供することが可能でございます。
ドラッグリポジショニングのフロー。化合物に特異的なgene signatureと公共データベースとの比較解析により疾患候補を抽出します。